Des scientifiques décodent le génome de l'olivier

Une équipe de scientifiques espagnols a publié pour la première fois le génome complet de l'olivier.

Par Isabel Putinja
30 juin 2016 07:43 UTC
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Des chercheurs du Centre de régulation génomique (CRG), du Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) et du Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) ont décodé le génome de l'olivier en utilisant un spécimen de 1,300 ans appartenant aux Espagnols. Variété Farga comme référence.

Au cours des 10 dernières années, un certain nombre d'espèces végétales ont vu leur code génétique assemblé, annoté et rendu public. Maintenant, l'olivier peut être ajouté à cette liste de génomes végétaux séquencés. Le projet de recherche de trois ans a été financé par la banque espagnole Banco Santander et publié le 27 juin 2016 dans GigaScience, une revue open-data

Le projet de recherche a été coordonné par Pablo Vargas, un chercheur du CSIC Real Jardín Botánico, qui a expliqué le processus dans un communiqué de presse:

"Le séquençage du génome comporte trois phases: premièrement, isoler tous les gènes, que nous avons publiés il y a deux ans. Deuxièmement, assembler le génome, qui consiste à ordonner ces gènes les uns après les autres, comme pour relier des phrases lâches dans un livre. Enfin, identifiez tous les gènes ou reliez le livre. Les deux dernières phases sont ce que nous avons fait et que nous présentons maintenant.

Pablo Vargas (CSIC)

Au cours du processus d'identification des gènes de l'olivier, les chercheurs ont découvert qu'il possédait plus de gènes 56,000, bien plus que d'autres espèces végétales, et le double de celui du génome humain.

Les chercheurs ont également révélé qu'en utilisant un spécimen d'olivier vieux de 1,300 ans, c'était la première fois qu'un aussi vieux "individu »a vu son génome séquencé. "Jusqu'à présent, tous les individus séquencés, de la mouche des fruits (Drosophila melanogaster) au premier être humain analysé, ont vécu un certain temps, en fonction de leur espérance de vie limitée. C'est la première fois que l'ADN d'un individu âgé de plus de 1,000 1,300 ans, et qui vivra probablement encore - - ans, est séquencé », ont révélé les chercheurs Pablo Vargas et Toni Gabaldón (CRG).

Comprendre le code génétique de l'olivier aidera les scientifiques à comprendre une variété de facteurs liés à l'arbre, y compris sa longévité, son adaptabilité aux conditions arides et les différences entre les variétés, les tailles et la saveur des olives. En fin de compte, cela facilitera également de nouvelles recherches sur l'amélioration génétique pour la production d'olives et d'huile d'olive, et sur la manière de protéger l'olivier contre les bactéries et les infections.

Afin de faciliter la recherche, le séquençage complet du génome de l'olivier a été mis à la disposition du domaine public sur le GigaScience Base de données GigaDB.


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